Material

Transparencias:

  1. Presentación (8 de febrero)
  2. Bioinformática y bilología molecular (8 de febrero, 10 de febrero)
  3. Alineamiento
  4. Secuenciación  (15 de marzo)
  5. Filogenética
  6. Señales en el ADN (5 de abril)

Temas para discusión y trabajos:

Prácticas:

  • Práctica 1 (22 de febrero)
  • Práctica 2 (1 de marzo)
    1. pract2_data
  • Práctica 3 (22 de marzo, 29 de marzo y 5 de abril)
    1. influenza.tar
    2. nd5.tar
    3. tubg1.tar
    4. Un par de dudas resueltas:
      1. Secuencias de ADN con caracteres extraños (Y, etc)
        • Respuesta. Los nucleótidos solo pueden ser A,C,G y T, pero hay veces que al secuenciar no se tiene claro el valor en una posición. Por ejemplo, si nuestra máquina de secuenciación sabe que en una posición no hay ni A ni G, pero entre las otras dos opciones (C,T) tiene dudas, en vez de decantarse por una y correr el riesgo de equivocarse, pondrá una Y. Para todas las posibles combinaciones hay letras equivalentes. Hay un estándar para esto, conocido como el código IUPAC [ADN,   proteínas]. Así pues, a la hora de contabilizar la frecuencia, Y contará como +0,5 a C y +0,5 a T.
      2. ¿Qué hacer con la fórmula de la página 3 cuando fv(i) es 0 (hay que tomar logaritmo)?
        • poner 0 en lugar del producto fv(i) ln fv(i)

Ejercicios:

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