Mediante CRISPR-Cas9 se generan glóbulos rojos personalizados según el grupo sanguíneo
Entrega práctica y ficheros grandes
Aún no he procesado las prácticas entregadas, pero por si no habéis entregado la última, existe un sistema de transmisión de ficheros para todos los usuarios de correo Unizar:
Matemáticas para descifrar la evolución de las especies
Artículo divulgativo sobre filogenia, incluyendo alternativas a los complicados métodos de “maximum likelihood” que vimos en clase
Entrega práctica 5
Recordad que el viernes 27 es el último día para entregar la práctica 5.
Me habéis comentado que en una secuencia de proteína hay alguna letra inesperada, se trata de códigos no estándar de aminoácidos (que representan duda entre varias opciones). Podéis cambiarla por la opción que queráis de entre las posibles o por un gap. Ocurre lo mismo en el caso de DNA (ver aquí) pero creo que no tenéis ningún ejemplo en la práctica.
Errata guión práctica 5
Debería haber un signo menos en la definición de entropía, ya está corregido en el guión. La definición correcta es
C(i) = – suma …
es decir, la entropía es siempre positiva y a menor entropía más conservada está la posición. Disculpad las molestias.
Como pescar el genoma de un pez con big data
Aquí describen el proceso de secuenciación y anotación del genoma del Yellowtail, con mucha computación de alto rendimiento
Presentaciones
El viernes 13 de abril sorteamos el orden de las presentaciones. Podéis ver algunas indicaciones en el apartado de “material”. Se ruega la asistencia a todas las presentaciones.
Viernes 27 de abril
11:10- 11:40 García Castillo, Oliva (CRISPR-Cas9)
11:40-12:10 Luesia (Enfermedades genéticas mitocondriales)
12:10-12:40 Martín, Sánchez (Alzheimer)
Miércoles 2 de mayo
10:00-10:30 Barbed, Cosculluela (Biopsia líquida)
10:30-11:00 Clemente, Milián (ADN mitocondrial e identificación de restos)
Viernes 4 de mayo
11:10-11:40 Crespo, Gómez (ADN mitocondrial y criminología)
11:40-12:10 Fuentemilla, del Molino (Secuenciadores de nueva generación)
12:10-12:40 Tellería (Complejidad en espacio y bioinformática)
Miércoles 9 de mayo
10:00-10:30 Delgado, García Sánchez (Epigenética)
Encuestas abiertas
Por favor contestadlas, vuestra opinión es importante. Es preferible que contestéis antes de la presentación de trabajos y evaluación de la asignatura.
Mañana hablamos de secuenciadores personales y NGS
Recordatorio: debéis elegir trabajo
Durante el mes de marzo debéis elegir todos tema de trabajo. Podéis explorar alguno de los temas comentados en clase (“temas para discusión y trabajos”) o proponer uno propio.
En caso de que no elijáis seleccionaré yo uno.
Una vez os dé el visto bueno debéis elegir la bibliografía que vais a usar y mandarmela. Os contestaré indicándoos si es suficiente, algún artículo adicional y los puntos concretos que debéis desarrollar en el trabajo.